RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FBXL2Q9UKC9 423 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NDUFS8O00217 210 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 GRIN3BO60391 1043 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PNMTP11086 282 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SLC2A1P11166 492 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FXYD4P59646 89 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 RGS13O14921 159 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR5H15A6NDH6 313 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR5H1A6NKK0 313 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 GTF2A2P52657 109 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 LIMK1P53667 647 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 KRTDAPP60985 99 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SCN1AP35498 2009 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GUH1 482 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 BLKP51451 505 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PGBD5Q8N414 524 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CRABP1P29762 137 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 C12orf29Q8N999 325 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF738Q8NE65 137 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 REEP6Q96HR9 211 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 GABRPO00591 440 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 DNPH1O43598 174 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ARNTP27540 789 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ELOBQ15370 118 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 VWA1Q6PCB0 445 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NRMQ8IXM6 262 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TDP1Q9NUW8 608 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 HIDE1A8MVS5 230 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TFAP2AP05549 437 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ADORA3P0DMS8 318 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 DRD2P14416 443 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 LTKP29376 864 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PLBD1Q6P4A8 553 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM163Q8TC26 289 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 AQP8O94778 261 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 DCTN6O00399 190 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 MSS51Q4VC12 460 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 PIGQQ9BRB3 760 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ELP3Q9H9T3 547 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 UCK1Q9HA47 277 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CCR9P51686 369 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 BDH1Q02338 343 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 HMCESQ96FZ2 354 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 A0A0A6YYJ9 748 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 GABARAPH6UMI1 98 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CCSO14618 274 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CLINT1Q14677 625 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.75□□□□□ -0.53
SOGA3-207ENST00000481848 LMF1Q96S06 567 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms