RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476472.5

ANKRD28-209, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-209ENST00000476472 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 KIR3DL1P43629 444 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GATA4P43694 442 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RFX3P48380 749 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 CLCN3P51790 818 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ST8SIA6P61647 398 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM3AP98173 230 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PLAURQ03405 335 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 MVKQ03426 396 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 AESQ08117 197 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 MESP2Q0VG99 397 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ST3GAL1Q11201 340 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PTP4A2Q12974 167 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PLA2G7Q13093 441 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RUNX2Q13950 521 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 FGFBP1Q14512 234 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GRM4Q14833 912 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GPNMBQ14956 572 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 NEDD8Q15843 81 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 HSPB2Q16082 182 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RBBP7Q16576 425 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 CBWD6Q4V339 395 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RAB41Q5JT25 222 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 CDCP2Q5VXM1 449 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 BICRALQ6AI39 1079 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF774Q6NX45 483 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 CASP12Q6UXS9 341 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SSX6Q7RTT6 188 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF720Q7Z2F6 126 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ADCK2Q7Z695 626 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 UBE3DQ7Z6J8 389 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 LINC01551Q86U37 167 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SLC34A3Q8N130 599 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 Q8N402 240 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM156Q8N614 296 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2T11Q8NH01 316 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR51F2Q8NH61 342 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR10A6Q8NH74 314 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RORBQ92753 470 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM46BQ96A09 425 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 RCN3Q96D15 328 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ASB9Q96DX5 294 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 TCTN2Q96GX1 697 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PGAM5Q96HS1 289 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 DCAF5Q96JK2 942 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 FCRL1Q96LA6 429 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SENP8Q96LD8 212 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 CDK15Q96Q40 435 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 HHIPQ96QV1 700 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2A14Q96R47 310 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 NPY6RQ99463 290 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GPA33Q99795 319 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 AGPAT1Q99943 283 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 GINS4Q9BRT9 223 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 BEX2Q9BXY8 128 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 LHPPQ9H008 270 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 SIK2Q9H0K1 926 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2AG1Q9H205 316 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-209ENST00000476472 THSD1Q9NS62 852 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms