RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CLDN15	P56746	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PNOC	Q13519	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	VEZF1	Q14119	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	AMER3	Q8N944	861 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	COX14	Q96I36	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1B0GUH1	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	EPHB6	O15197	1021 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MED7	O43513	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GLRA3	O75311	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SEC22B	O75396	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	VCL	P18206	1134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IL10	P22301	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IL4R	P24394	825 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IER3	P46695	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CAPZB	P47756	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GSDMD	P57764	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MAX	P61244	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF235	Q14590	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PPA1	Q15181	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NPW	Q8N729	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PROX1	Q92786	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		A0A0J9YWU9	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ARPC2	O15144	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TTI1	O43156	1089 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	HCRTR1	O43613	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MTX2	O75431	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	F10	P00742	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	EPOR	P19235	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TEAD1	P28347	426 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CSNK1D	P48730	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PAX9	P55771	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NME5	P56597	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	STX17	P56962	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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