RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 RENP00797 406 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAMP1P11279 417 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 IDSP22304 550 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD1CP29017 333 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPRD1P41143 372 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 HLCSP50747 726 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC8A3P57103 927 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAX8Q06710 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CUL1Q13616 776 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF77Q15935 545 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 C9orf40Q8IXQ3 194 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SVOPLQ8N434 492 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 HTR3CQ8WXA8 447 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SERAC1Q96JX3 654 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 IFT74Q96LB3 600 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 C12orf42Q96LP6 360 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCHR1Q99705 422 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CENPKQ9BS16 269 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PANK3Q9H999 370 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 WWOXQ9NZC7 414 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 BFARQ9NZS9 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1B0GWB2 263 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1W2PPV9 198 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR2AG2A6NM03 316 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 IDSB3KWA1 339 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 C9JVG2 144 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 E9PAM4 449 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNA14O95837 355 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 LGALS2P05162 132 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPEP1P16444 411 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNNI1P19237 187 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 KITLGP21583 273 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 XCR1P46094 333 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 STARP49675 285 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDH6P55285 790 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 C21orf59P57076 290 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 MICBQ29980 383 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ISXQ2M1V0 245 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 LEMD1Q68G75 181 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 STARD8Q92502 1023 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELMO1Q92556 727 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PEX13Q92968 403 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNA7Q96RP8 456 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSMB7Q99436 277 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 FMO2Q99518 471 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADNPQ9H2P0 1102 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 CUTCQ9NTM9 273 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDE10AQ9Y233 779 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A087WYN8 130 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFCAB7A8K855 629 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 H7C423 109 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 LATO43561 262 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 DFNA5O60443 496 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms