RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RETNLBQ9BQ08 111 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NTMT1Q9BV86 223 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ROGDIQ9GZN7 287 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HMG20AQ9NP66 347 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM169AQ9Y6X4 670 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CFLARO15519 480 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PPIHO43447 177 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SGSHP51688 502 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SELENOTP62341 195 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCDC173Q0VFZ6 552 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NFE2L1Q14494 772 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PYDC2Q56P42 97 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR4F15Q8NGB8 312 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC01560Q8TB33 94 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ACTRT1Q8TDG2 376 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 P3H4Q92791 437 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GLYATL1Q969I3 302 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KLHDC3Q9BQ90 382 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC25A23Q9BV35 468 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ACPTQ9BZG2 426 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC25A51Q9H1U9 297 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 POLD4Q9HCU8 107 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 VPS28Q9UK41 221 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 R4GN34 69 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A8MUI8 341 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PEX7O00628 323 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CD74P04233 296 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GSTA1P08263 222 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BDNFP23560 247 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DCKP27707 260 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KLK7P49862 253 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC34A1Q06495 639 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC10A7Q0GE19 358 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FUT5Q11128 374 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GUCA2BQ16661 112 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RILPL1Q5EBL4 403 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERMARDQ5T6L9 678 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SHEQ5VZ18 495 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM91A1Q658Y4 838 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 STUMQ69YW2 141 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCDC54Q8NEL0 328 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GANQ9H2C0 597 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 YY1AP1Q9H869 796 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DOCK6Q96HP0 2047 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 URADA6NGE7 173 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MBTPS2O43462 519 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CHRNGP07510 517 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF688P0C7X2 276 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 INAFM2P0DMQ5 153 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RFC2P35250 354 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FRKP42685 505 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DLX1P56177 255 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PPIL2Q13356 520 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DOC2AQ14183 400 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 STX1AQ16623 288 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF699Q32M78 642 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM52BQ4KMG9 183 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZFP1Q6P2D0 407 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC22A16Q86VW1 577 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BRSK1Q8TDC3 778 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 B3GNT2Q9NY97 397 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC25A15Q9Y619 301 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM120BA0PK00 339 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARHGEF35A5YM69 484 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ANXA2P2A6NMY6 339 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 H0YHG0 523 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ECI2O75521 394 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GNAO1P09471 354 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR56A5P0C7T3 313 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF30P17039 623 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 G6PCP35575 357 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CAPZA2P47755 286 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CXCL12P48061 93 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GEMP55040 296 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HYAL4Q2M3T9 481 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM95Q3KNT9 176 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CYBRD1Q53TN4 286 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms