RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TBCKQ8TEA7 893 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RORBQ92753 470 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GAD1Q99259 594 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACOX2Q99424 681 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PITX2Q99697 317 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CNPY3Q9BT09 278 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC22A4Q9H015 551 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PIGUQ9H490 435 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RNF121Q9H920 327 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RNF122Q9H9V4 155 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 BIN3Q9NQY0 253 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EXD2Q9NVH0 621 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GPR83Q9NYM4 423 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 STUB1Q9UNE7 303 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LTBP4Q8N2S1 1624 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PTPRJQ12913 1337 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TRPM7Q96QT4 1865 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 H0YIN7 160 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PEX12O00623 359 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2CO00762 179 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ARPC2O15144 300 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TO15178 435 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RAD1O60671 282 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HUS1O60921 280 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CABYRO75952 493 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SNAPC5O75971 98 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 IFNA7P01567 189 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C9P02748 559 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AKR1B1P15121 316 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GNSP15586 552 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CBR1P16152 277 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ALOX12P18054 663 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TPSB2P20231 275 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HTR1EP28566 365 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CA5AP35218 305 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RFC3P40938 356 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MATKP42679 507 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK10P57789 538 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 STARD6P59095 220 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MYL7Q01449 175 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SP3Q02447 781 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PUDPQ08623 228 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAA1Q13131 559 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PRKG2Q13237 762 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ART3Q13508 389 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NAE1Q13564 534 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 NCF4Q15080 339 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TPSAB1Q15661 275 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 GUCA2BQ16661 112 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 MEP1AQ16819 746 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RFX4Q33E94 735 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 AARDQ4LEZ3 155 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SAXO2Q658L1 398 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 PHC2Q8IXK0 858 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SVOPLQ8N434 492 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 RNF148Q8N7C7 305 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ACTL9Q8TC94 416 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-202ENST00000367364 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142 ms