RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CBLN3Q6UW01 205 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 LUZP1Q86V48 1076 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CCDC185Q8N715 623 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 MCHR2Q969V1 340 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SLC35C1Q96A29 364 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TPD52L3Q96J77 140 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 VPS35Q96QK1 796 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 CFAP45Q9UL16 551 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 OR1A2Q9Y585 309 aa4.84□□□□□ -1.63
CCL20-201ENST00000358813 U3KQA8 63 aa4.84□□□□□ -1.63
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CCL20-201ENST00000358813 A8MU76 341 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 EPHB6O15197 1021 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 GLRA3O75311 464 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 CTNNA2P26232 953 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 DLSTP36957 453 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 ETV5P41161 510 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 PFN3P60673 137 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 SLC34A3Q8N130 599 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 P3H4Q92791 437 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 C4orf36Q96KX1 117 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 ZNF778Q96MU6 729 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 DMAC2Q9NW81 257 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.83□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 CREBBPQ92793 2442 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 SOCS2O14508 198 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 ATP6V0E1O15342 81 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 MLNRO43193 412 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 BUB1O43683 1085 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 KRT86O43790 486 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 DPM1O60762 260 aa4.82□□□□□ -1.64
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