RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MED20Q9H944 212 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.91■□□□□ 0.94
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PTPRM-201ENST00000332175 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BNC9 293 aa20.9■□□□□ 0.94
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PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF17Q02223 184 aa20.88■□□□□ 0.93
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
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