RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 CCKBRP32239 447 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 IER3P46695 156 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SOX2P48431 317 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CDC42P60953 191 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 IL13RA1P78552 427 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 FPGSQ05932 587 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 UTF1Q5T230 341 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MED27Q6P2C8 311 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZVL8 140 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 XYLT1Q86Y38 959 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 OR2M7Q8NG81 312 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TMEM163Q8TC26 289 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CD200R1Q8TD46 325 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TMEM203Q969S6 136 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ZG16BQ96DA0 208 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SFRP2Q96HF1 295 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ZIC5Q96T25 663 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GPR174Q9BXC1 333 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 PIGMQ9H3S5 423 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GPAMQ9HCL2 828 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 METRNQ9UJH8 293 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MEMO1Q9Y316 297 aa6.4□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SNED1Q8TER0 1413 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TRDCB7Z8K6 153 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TOX4O94842 621 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 EFEMP2O95967 443 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 C2P06681 752 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 FURINP09958 794 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SERPINA2P20848 420 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GABRR2P28476 465 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 FOXN2P32314 431 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CSKP41240 450 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 PPOXP50336 477 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CHN2P52757 468 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MVDP53602 400 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NAPAP54920 295 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TPTEP56180 551 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TEKQ02763 1124 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 POU2AF1Q16633 256 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 AGKQ53H12 422 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 PPM1JQ5JR12 505 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZVU0 165 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 OR2T11Q8NH01 316 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GLTPQ9NZD2 209 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GTI1 187 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 TMEM129A0AVI4 362 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CLDN34H7C241 214 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 AIREO43918 545 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 CEACAM4O75871 244 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 DRD4P21917 467 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GNRHRP30968 328 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 BCL6P41182 706 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 ACLYP53396 1101 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 GTF2BQ00403 316 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-202ENST00000327307 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms