RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274545.9

GABRA6-201, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRA6, Length 2,128 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6-201ENST00000274545 CKMT1AP12532 417 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MAKP20794 623 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TGFBR1P36897 503 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 PPICP45877 212 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MTNR1AP48039 350 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ENTPD1P49961 510 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SSTP61278 116 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 RHAGQ02094 409 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 PRKCDQ05655 676 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 NDUFAF6Q330K2 333 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 Q3ZCU0 254 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SMARCD3Q6STE5 483 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZNF550Q7Z398 422 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MRGPREQ86SM8 312 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 EID2Q8N6I1 236 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OR4Q3Q8NH05 313 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 FGF11Q92914 225 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SAMD8Q96LT4 415 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SLC46A1Q96NT5 459 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OR6C1Q96RD1 312 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TRIM2Q9C040 744 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OR52D1Q9H346 318 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 HHATLQ9HCP6 504 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CTSFQ9UBX1 484 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 POLHQ9Y253 713 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CDH10Q9Y6N8 788 aa7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 UNC119BA6NIH7 251 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 RFPL3O75679 317 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 APOL3O95236 402 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 LYPD3O95274 346 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SLC2A10O95528 541 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 GADD45AP24522 165 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 FOXL2P58012 376 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 GPR85P60893 370 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 COPZ1P61923 177 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CCL7P80098 99 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SPHARQ15513 63 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ULK3Q6PHR2 472 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CMIPQ8IY22 773 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 FANK1Q8TC84 345 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZNF721Q8TF20 911 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 OTULINQ96BN8 352 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ADOQ96SZ5 270 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TM9SF2Q99805 663 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MND1Q9BWT6 205 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 UBQLN3Q9H347 655 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 STMN3Q9NZ72 180 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 U3KQA8 63 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.99□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 FAM183AA6NL82 134 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SCDO00767 359 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 GNB5O14775 395 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 SULT1C4O75897 302 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 DDAH2O95865 285 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 HMGN1P05114 100 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.98□□□□□ -1.29
GABRA6-201ENST00000274545 ICAM2P13598 275 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms