RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 F3P13726 295 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CPEP16870 476 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 AGTR1P30556 359 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TOR2AQ5JU69 321 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PLPP6Q8IY26 295 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C10orf111Q8N326 155 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FCRL1Q96LA6 429 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 POT1Q9NUX5 634 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CPNE7Q9UBL6 633 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GOSR2O14653 212 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5AP00167 134 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GABRA3P34903 492 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SSX1Q16384 188 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 Q9N2J8 555 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 COPS3Q9UNS2 423 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PROS1P07225 676 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 HTR2AP28223 471 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 GDNFP39905 211 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MTNR1BP49286 362 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TPMTP51580 245 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RAP2BP61225 183 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FABP5Q01469 135 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CD276Q5ZPR3 534 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SOCS6O14544 535 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OPRD1P41143 372 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CXCL12P48061 93 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf189Q5VU69 101 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 APOOLQ6UXV4 268 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ATCAYQ86WG3 371 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 STOML3Q8TAV4 291 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRFP10586 1907 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KCNJ13O60928 360 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ETHE1O95571 254 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 RAF1P04049 648 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NPPBP16860 134 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CLDN20P56880 219 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ERVK-25P63136 954 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ASB6Q9NWX5 421 aa15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ARID2Q68CP9 1835 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 F5H5P2 479 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 UBL3O95164 117 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PSMB10P40306 273 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ADPRHP54922 357 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 B4GALNT1Q00973 533 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM239Q8WW34 195 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 PELI2Q9HAT8 420 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF823P16415 610 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 CD6P30203 668 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 NUDT1P36639 197 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.91■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms