RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DPB1P04440 258 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 WT1P19544 449 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BSGP35613 385 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 EVX1P49640 407 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL2Q16842 350 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf189Q5VU69 101 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 VN1R4Q7Z5H5 301 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR135Q8IZ08 494 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCF1Q8N6M8 205 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF7Q8N8F6 280 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MORN4Q8NDC4 146 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8K5Q8NH50 307 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT12Q8WYK0 555 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB8BQ92930 207 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM203Q969S6 136 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MED30Q96HR3 178 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 AIF1LQ9BQI0 150 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A8Q9BY19 250 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ATMQ13315 3056 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CASKO14936 926 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 EFSO43281 561 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 EFR3AQ14156 821 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM5Q6NUN0 579 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CNIH2Q6PI25 160 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35G5Q96KT7 338 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ15Q99712 375 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB6Q9NWX5 421 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LYRM1O43325 122 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM157BP0CG42 384 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 F8A1P23610 371 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR8P51685 355 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT13Q86X67 352 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TM9SF4Q92544 642 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1BQ00975 2339 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 NR2F1P10589 423 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CD82P27701 267 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RORAP35398 523 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 GCGRP47871 477 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KHKP50053 298 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP5Q01469 135 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DSG2Q14126 1118 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 Q5BKY6 102 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 BICRALQ6AI39 1079 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SHISA5Q8N114 240 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP21Q8N119 569 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD19PQ9H560 264 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MED17Q9NVC6 651 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG5Q9Y673 324 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PSKH1P11801 424 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN2A2P49641 1150 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXL2P58012 376 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB3Q12988 150 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MAB21L1Q13394 359 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHB9Q6PI77 547 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IL22RA1Q8N6P7 574 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD53Q8N9V6 530 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 POGLUT1Q8NBL1 392 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF485Q8NCK3 441 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKK1Q8NFD2 765 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 GATAD2BQ8WXI9 593 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CREB3L1Q96BA8 519 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 JAM3Q9BX67 310 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MEN1O00255 615 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1F1O43749 312 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FHP07954 510 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DRD2P14416 443 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP1P49441 399 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 BTG1P62324 171 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TLE3Q04726 772 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC58Q4VC31 144 aa24.25■■□□□ 1.47
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