RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 CPOXP36551 454 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 DCAF7P61962 342 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CHRNEQ04844 493 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 KEAP1Q14145 624 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 RGNQ15493 299 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TESK1Q15569 626 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 DCST1Q5T197 706 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 VASNQ6EMK4 673 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NANOGP8Q6NSW7 305 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CBLN3Q6UW01 205 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 LUZP2Q86TE4 346 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 MARCH3Q86UD3 253 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 IFNEQ86WN2 208 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NATD1Q8N6N6 113 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 GATSQ8NAP1 163 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NAXEQ8NCW5 288 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 LINC01560Q8TB33 94 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 GPR151Q8TDV0 419 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 FAM222BQ8WU58 562 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 JADE3Q92613 823 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ROPN1LQ96C74 230 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC58Q96CX6 371 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SFXN2Q96NB2 322 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 COL21A1Q96P44 957 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 STACQ99469 402 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ZBTB18Q99592 522 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CGREF1Q99674 301 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 BTBD2Q9BX70 525 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 UBQLN3Q9H347 655 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NANOGQ9H9S0 305 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 RASSF1Q9NS23 344 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.3□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 MED13LQ71F56 2210 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CD8B2A6NJW9 211 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SLC22A2O15244 555 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 EFNA2O43921 213 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TPST1O60507 370 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 UBOX5O94941 541 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 H6PDO95479 791 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NTN1O95631 604 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 BCHEP06276 602 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ALOX5P09917 674 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 EVI2BP34910 448 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 RFX3P48380 749 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PRIM2P49643 509 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 STARP49675 285 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 KHKP50053 298 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF136P52737 540 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PNLIPRP2P54317 469 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 DSTNP60981 165 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PRR5P85299 388 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 STX5Q13190 355 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SNTA1Q13424 505 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 NFYCQ13952 458 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 EFR3AQ14156 821 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 KLHL26Q53HC5 615 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 COQ5Q5HYK3 327 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 AAGABQ6PD74 315 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 RINLQ6ZS11 566 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 VRK2Q86Y07 508 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 CDC20BQ86Y33 519 aa5.29□□□□□ -1.56
LINC00963-215ENST00000622972 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms