RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS7O75251 213 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 H6PDO95479 791 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 EDNRAP25101 427 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PPA1Q15181 289 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 STK11Q15831 433 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 OR5D16Q8NGK9 328 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 AGR3Q8TD06 166 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ARL8AQ96BM9 186 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 APOPT1Q96IL0 206 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 OR5B2Q96R09 309 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 MECRQ9BV79 373 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SERINC4A6NH21 518 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF724A8MTY0 619 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SHISA9B4DS77 424 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PRPS1L1P21108 318 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CCR4P51679 360 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SKP2Q13309 424 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 IL23RQ5VWK5 629 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SSX8Q7RTT4 187 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 DTX2Q86UW9 622 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 MUCL1Q96DR8 90 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 LAT2Q9GZY6 243 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ALG2Q9H553 416 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CFLARO15519 480 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 CD5LO43866 347 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM11O75078 769 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 COX5AP20674 150 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-2P23083 117 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 HBA1P69905 142 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF141Q15928 474 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM23BQ5SRD1 257 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ST8SIA1Q92185 356 aa22.03■■□□□ 1.12
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PTPRF-216ENST00000617451 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 KCNE5Q9UJ90 142 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PLCE1Q9P212 2302 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 PGM3O95394 542 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 GGT1P19440 569 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ARRB2P32121 409 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SESN3P58005 492 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 C21orf58P58505 322 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP26Q9BV47 211 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 DUXAA6NLW8 204 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 FCMRO60667 390 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 DIO1P49895 249 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CDH11P55287 796 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 GPR68Q15743 365 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TMPPEQ6ZT21 453 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SERINC1Q9NRX5 453 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 OR5H1A6NKK0 313 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ABCD4O14678 606 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 STX11O75558 287 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B17O75795 530 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 CYP7B1O75881 506 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 AK1P00568 194 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 MATN1P21941 496 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SOAT1P35610 550 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB5P36952 375 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 HMBOX1Q6NT76 420 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM234Q8WY98 164 aa22■■□□□ 1.11
PTPRF-216ENST00000617451 RADILQ96JH8 1075 aa22■■□□□ 1.11
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