RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	E2F6	O75461	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	DIRAS1	O95057	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RASAL1	O95294	804 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	HPR	P00739	348 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PRG2	P13727	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ANXA8	P13928	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	MAP2K6	P52564	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R41	P59536	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SPIB	Q01892	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF117	Q03924	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	MFAP5	Q13361	173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CBFB	Q13951	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	DCST1	Q5T197	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CIB1	Q99828	191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	FRS3	O43559	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	HCRTR2	O43614	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CHP2	O43745	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM11	O75078	769 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CCNB2	O95067	398 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	IGF2	P01344	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392		P04436	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PNMT	P11086	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CNR1	P21554	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	HTR2A	P28223	471 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CD96	P40200	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SLC1A3	P43003	542 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CDH12	P55289	794 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RFX4	Q33E94	735 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	VNN3	Q9NY84	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392		A0A087WUJ7	227 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392		A0A1B0GWA3	101 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	SCO2	O43819	266 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	LYPD3	O95274	346 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	THY1	P04216	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	IFNGR2	P38484	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	HTR3A	P46098	478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CELF4-222	ENST00000601392	IST1	P53990	364 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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