RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZER1Q7Z7L7 766 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT16Q8N428 558 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF217Q8TC41 542 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR119Q8TDV5 335 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CYGBQ8WWM9 190 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM234Q8WY98 164 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM19Q9H013 955 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT9Q9HCQ5 603 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM118AQ9NWS6 357 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM5Q9Y2B1 443 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 MED31Q9Y3C7 131 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A6O15403 523 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT14O95848 222 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1RL1Q01638 556 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT5Q7Z7M9 940 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 BEST3Q8N1M1 668 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 MARVELD2Q8N4S9 558 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CAPNS1-206ENST00000588815 MBOAT4Q96T53 435 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC19A3Q9BZV2 496 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 UCK2Q9BZX2 261 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-8O15522 239 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 MITFO75030 526 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX4O95219 450 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GP1BBP13224 206 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ESRRGP62508 458 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC20Q12834 499 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NPRL3Q12980 569 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR88Q6ZMY6 472 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R10Q9NYW0 307 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ARGFXA6NJG6 315 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2P01344 180 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR3AP46098 478 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 OMPP47874 163 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX5P56178 289 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCDQ05655 676 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN31Q12999 210 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IL18R1Q13478 541 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 BICRALQ6AI39 1079 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NRMQ8IXM6 262 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK20Q8IZL9 346 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIP2Q9C0E4 1043 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL3P10147 92 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 POU2F1P14859 743 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 GSSP48637 474 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 CTBP2P56545 445 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL17Q6TDP4 642 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 USP51Q70EK9 711 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM43Q9BTV4 400 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 RIBC2Q9H4K1 309 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 SACM1LQ9NTJ5 587 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 P04436 131 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 OSMP13725 252 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 FPR3P25089 353 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 KEAP1Q14145 624 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 QPRTQ15274 297 aa28.25■■■□□ 2.11
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CAPNS1-206ENST00000588815 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 GRINAQ7Z429 371 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOA3Q8NG57 546 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ING2Q9H160 280 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGES2Q9H7Z7 377 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 DKK4Q9UBT3 224 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAR1AP10644 381 aa28.24■■■□□ 2.11
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CAPNS1-206ENST00000588815 MYF6P23409 242 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 MST1P26927 711 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 FADS6Q8N9I5 356 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM41AQ96HV5 264 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP4Q96P64 663 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF20Q5VT98 475 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ISLR2Q6UXK2 745 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF32Q9H0A6 362 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 MED11Q9P086 117 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 REV1Q9UBZ9 1251 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf72A6NCS6 295 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PQ18 207 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF4O43474 513 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TACR3P29371 465 aa28.22■■■□□ 2.11
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