RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 SLC35B4Q969S0 331 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 C3orf49Q96BT1 292 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 PIP5K1AQ99755 562 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 UBQLN3Q9H347 655 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 ACER3Q9NUN7 267 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 MED17Q9NVC6 651 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 U3KQV3 271 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-216ENST00000549221 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MED12Q93074 2177 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 FAAHO00519 579 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 CDK2AP1O14519 115 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 EFNA2O43921 213 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PIP5K1CO60331 668 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 DPM1O60762 260 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 WISP2O76076 250 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SNX4O95219 450 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 OR5F1O95221 314 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 NUDT14O95848 222 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 LDLRP01130 860 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ITGB2P05107 769 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 CELA3AP09093 270 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PRKCAP17252 672 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 IL11P20809 199 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 FASP25445 335 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PEX2P28328 305 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SLC6A8P48029 635 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MASP1P48740 699 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MEOX1P50221 254 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SESN3P58005 492 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 CBFBQ13951 182 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 COLEC12Q5KU26 742 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 LPCAT4Q643R3 524 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZNF613Q6PF04 617 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 Q6ZS92 163 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PACS2Q86VP3 889 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 P3H2Q8IVL5 708 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 RELTQ969Z4 430 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZNF597Q96LX8 424 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 C5orf34Q96MH7 638 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZNF347Q96SE7 839 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZNF559Q9BR84 538 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 MFRPQ9BY79 579 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TRIM2Q9C040 744 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 LUZP4Q9P127 313 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 VDAC3Q9Y277 283 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 A0A087WUU8 490 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PRQ8 180 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 FAM166BA8MTA8 275 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 PDLIM1O00151 329 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 TNFRSF11BO00300 401 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-216ENST00000549221 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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