RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 PRPH2P23942 346 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 STC1P52823 247 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 ETFDHQ16134 617 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 OR4K15Q8NH41 348 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 A6NIZ1 184 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 SPNP16150 400 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 PGCP20142 388 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 DPEP1P16444 411 aa8.12□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 TVP23CQ96ET8 276 aa8.11□□□□□ -1.11
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ATXN3-216ENST00000545170 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.11□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.11□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.11□□□□□ -1.11
ATXN3-216ENST00000545170 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
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