RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SAMD8	Q96LT4	415 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SERPINB11	Q96P15	392 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LITAF	Q99732	161 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PINK1	Q9BXM7	581 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	STRADB	Q9C0K7	418 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SP140L	Q9H930	580 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DYRK4	Q9NR20	520 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LAMA1	P25391	3075 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0U1RRA0	63 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	OR5H15	A6NDH6	313 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ZW10	O43264	779 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TNFSF12	O43508	249 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SOCS5	O75159	536 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	APOE	P02649	317 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	GSTA1	P08263	222 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CFC1	P0CG37	223 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	SLC2A3	P11169	496 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	KRT13	P13646	458 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	GLRA1	P23415	457 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ADORA2B	P29275	332 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PRDX6	P30041	224 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	GTF2H1	P32780	548 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CSK	P41240	450 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PSMD8	P48556	350 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	MTTP	P55157	894 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	NUCB2	P80303	420 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	P2RY14	Q15391	338 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CATSPER2	Q96P56	530 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	NMUR1	Q9HB89	426 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	STARD5	Q9NSY2	213 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	BPTF	Q12830	3046 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM2-223	ENST00000536089	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86

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