RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512700.1

NSD2-222, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 2, human

TSL 5

Gene NSD2, Length 1,095 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD2-222	ENST00000512700	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	RAB8B	Q92930	207 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	TESC	Q96BS2	214 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	PERP	Q96FX8	193 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NSD2-222	ENST00000512700	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700		C9JVG2	144 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SULT2B1	O00204	365 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	KLF4	O43474	513 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ADA	P00813	363 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	THBD	P07204	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	INHBB	P09529	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	KIT	P10721	976 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	BST1	Q10588	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	GNA13	Q14344	377 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	CASP8	Q14790	479 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700		Q5PR19	223 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SORT1	Q99523	831 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	BDH2	Q9BUT1	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ERLIN1	O75477	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ANP32D	O95626	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	NTN1	O95631	604 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	FES	P07332	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	UFM1	P61960	85 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	KCNJ10	P78508	379 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SKP2	Q13309	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	P2RY6	Q15077	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	S100PBP	Q96BU1	408 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	NEURL3	Q96EH8	262 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700		Q96MF0	132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	RFXANK	O14593	260 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	HS3ST1	O14792	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NSD2-222	ENST00000512700	HDAC3	O15379	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms