RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ELMO1Q92556 727 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 FGF11Q92914 225 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ECHDC3Q96DC8 303 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MTERF3Q96E29 417 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 RNFT2Q96EX2 444 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 LINGO1Q96FE5 620 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM80Q96HE8 168 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRG7Q96K78 797 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 DGAT2Q96PD7 388 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PANX1Q96RD7 426 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 NODALQ96S42 347 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF607Q96SK3 696 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 C12orf57Q99622 126 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CHP1Q99653 195 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PRRT1Q99946 306 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 NAT9Q9BTE0 207 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ANKRD60Q9BZ19 345 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PRRG3Q9BZD7 231 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SLC19A3Q9BZV2 496 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 P2RY12Q9H244 342 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 COA4Q9NYJ1 87 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 GTSE1Q9NYZ3 720 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SIX4Q9UIU6 781 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SARDHQ9UL12 918 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PADI1Q9ULC6 663 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 HYOU1Q9Y4L1 999 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GUH1 482 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1W2PRB8 838 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MYBPHLA2RUH7 354 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 OR2A25A4D2G3 310 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 FAM172BPA6NC97 362 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 C5orf60A6NFR6 353 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 A8MXQ7 604 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 H3BQF6 201 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC188H7C350 402 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SLC22A2O15244 555 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 AQP9O43315 295 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CHMP2AO43633 222 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 LANCL1O43813 399 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 DFNA5O60443 496 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 DPM1O60762 260 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 LRCH4O75427 683 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 NDUFS3O75489 264 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MED6O75586 246 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 DFFBO76075 338 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 VAMP5O95183 116 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ANP32DO95626 131 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ATP6V1G2O95670 118 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TNNC2P02585 160 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 FCER2P06734 321 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 GUSBP08236 651 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM49P0CI25 452 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM49CP0CI26 452 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 GIMD1P0DJR0 217 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 PSKH1P11801 424 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 CD36P16671 472 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MAGP20916 626 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 MYF6P23409 242 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 F8A1P23610 371 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 DTYMKP23919 212 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 BDKRB2P30411 391 aa2.73□□□□□ -1.97
ATXN3-211ENST00000511362 SSTR2P30874 369 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms