RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 HMGN4O00479 90 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 PLAUP00749 431 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CSTAP01040 98 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP3CBP16298 524 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 EPHA3P29320 983 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 KHKP50053 298 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 SESN3P58005 492 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 TSC22D1Q15714 1073 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 MAPK11Q15759 364 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ACKR1Q16570 336 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 BEND4Q6ZU67 534 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ST8SIA1Q92185 356 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 TLCD1Q96CP7 247 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 POM121Q96HA1 1249 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 PIP5K1AQ99755 562 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10A4Q9H209 315 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 BCO1Q9HAY6 547 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 GP6Q9HCN6 339 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 POLE3Q9NRF9 147 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 EXD2Q9NVH0 621 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR45Q9Y484 360 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ZFHX3Q15911 3703 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 GJE1A6NN92 205 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 HDAC3O15379 428 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CYP7B1O75881 506 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CHRM4P08173 479 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 FOSL1P15407 271 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 S100A3P33764 101 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 MVDP53602 400 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 RAC3P60763 192 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CHRNEQ04844 493 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 BEX5Q5H9J7 111 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 COX20Q5RI15 118 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 HHATQ5VTY9 493 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF130Q86XS8 419 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKFN1Q8N957 763 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 S100PBPQ96BU1 408 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 SMR3AQ99954 134 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC38A1Q9H2H9 487 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ACER3Q9NUN7 267 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 ACANP16112 2415 aa11.27□□□□□ -0.6
SH3BP2-216ENST00000510193 AP3D1O14617 1153 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 CYTIPO60759 359 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 PRKD3O94806 890 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 AGR2O95994 175 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 PGRP06401 933 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC7A1P30825 629 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC18A1P54219 525 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 MERTKQ12866 999 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SYPL1Q16563 259 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SYT14P1Q58G82 188 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 Q5PR19 223 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 STK32CQ86UX6 486 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 OR5B2Q96R09 309 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 TIGARQ9NQ88 270 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP2-216ENST00000510193 CTPS2Q9NRF8 586 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms