RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 LILRB3O75022 631 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ITGA10O75578 1167 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CSF3P09919 207 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PEPDP12955 493 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DRD3P35462 400 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OPRD1P41143 372 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PITPNAQ00169 270 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXK2Q01167 660 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFRSF17Q02223 184 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 C4orf46Q504U0 113 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF511Q8NB15 262 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 AVL9Q8NBF6 648 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM3CQ92520 227 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CDHR4A6H8M9 788 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DNASE1P24855 282 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 BLKP51451 505 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SETD6Q8TBK2 473 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NR4A3Q92570 626 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ADOQ96SZ5 270 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TRPM7Q96QT4 1865 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GWA3 101 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF13O43567 381 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RENP00797 406 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SPARCP09486 303 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K8P41279 467 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CRYBB2P43320 205 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFB2O95178 105 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 C4BPBP20851 252 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGA2P52926 109 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ADPRHP54922 357 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TAS2R43P59537 309 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPAN5P62079 268 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP2Q05923 314 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RUNX2Q13950 521 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC190Q86UF4 302 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SUN5Q8TC36 379 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXL4Q9UKA2 621 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1D4P47884 311 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DNASE1L1P49184 302 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 KIR2DS3Q14952 304 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF550Q7Z398 422 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2T35Q8NGX2 323 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SFXN5Q8TD22 340 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN1LWP04000 364 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 TACSTD2P09758 323 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKCAP17252 672 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ELK1P19419 428 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ERP29P30040 261 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MYADMQ96S97 322 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 DAPP1Q9UN19 280 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 MAKP20794 623 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 CCR6P51684 374 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 UBQLNLQ8IYU4 475 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC7A6Q92536 515 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms