RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NRMQ8IXM6 262 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM80Q96HE8 168 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CEP19Q96LK0 163 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OPALINQ96PE5 141 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 METTL15A6NJ78 407 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CTDSP2O14595 271 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MYL12BO14950 172 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CSO75390 466 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CPMP14384 443 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MC2RQ01718 297 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRAM2Q15035 370 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAPK14Q16539 360 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDC73Q6P1J9 531 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FANK1Q8TC84 345 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR151Q8TDV0 419 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SERINC2Q96SA4 455 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IL21RQ9HBE5 538 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HHATLQ9HCP6 504 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM60AQ9NP50 221 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PHF11Q9UIL8 331 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LIPT1Q9Y234 373 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PCSK5Q92824 1860 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRG6 482 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR5K4A6NMS3 321 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PEX12O00623 359 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RDH16O75452 317 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TNFP01375 233 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 THEGLP0DJG4 465 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ACP2P11117 423 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC15A1P46059 708 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BLKP51451 505 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ST3GAL3Q11203 375 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ESCO2Q56NI9 601 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TOR2AQ5JU69 321 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DIO2Q92813 273 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TP53INP1Q96A56 240 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MOAP1Q96BY2 351 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BEX2Q9BXY8 128 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NUAK2Q9H093 628 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 URADA6NGE7 173 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM183AA6NL82 134 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DUXAA6NLW8 204 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C2orf74A8MZ97 194 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRIM77I1YAP6 450 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PLD2O14939 933 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A10O95528 541 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IGHEP01854 428 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 THY1P04216 161 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CT62P0C5K7 136 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FGF5P12034 268 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ST6GAL1P15907 406 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SOX18P35713 384 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ETV5P41161 510 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMSP52788 366 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TEKQ02763 1124 aa6.48□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ERV3-1Q14264 604 aa6.48□□□□□ -1.37
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