RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 TFPTP0C1Z6 253 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FCGR2AP12318 317 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PGCP20142 388 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CPOXP36551 454 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CARD18P57730 90 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MERTKQ12866 999 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ST8SIA1Q92185 356 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SLC52A3Q9NQ40 469 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ACER3Q9NUN7 267 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MSTNO14793 375 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 IL7RP16871 459 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A1P30825 629 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MAGEA8P43361 318 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SELENBP1Q13228 472 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GUSBP1Q15486 140 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 RGNQ15493 299 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FAM214BQ7L5A3 538 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 VRK2Q86Y07 508 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 KIF18BQ86Y91 864 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 C10orf111Q8N326 155 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF563Q8TA94 476 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 MAL2Q969L2 176 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TMEM19Q96HH6 336 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF385DQ9H6B1 395 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 VAPAQ9P0L0 249 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PP18 115 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GJE1A6NN92 205 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CGAP01215 116 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GKN3PP0CG01 181 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 KLK2P20151 261 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CRISP3P54108 245 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CTBP2P56545 445 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SORDQ00796 357 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GUCY1A3Q02108 690 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FAM27E3Q08E93 113 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GNA13Q14344 377 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FAM222BQ8WU58 562 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ABHD3Q8WU67 409 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 STON2Q8WXE9 905 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TMEM234Q8WY98 164 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 DNAJA3Q96EY1 480 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 OR5B2Q96R09 309 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 IKZF5Q9H5V7 419 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TIGARQ9NQ88 270 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 RLIMQ9NVW2 624 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 CALML5Q9NZT1 146 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 PROCRQ9UNN8 238 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.74□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TMEM247A6NEH6 219 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NISCH-214ENST00000490425 TFPIP10646 304 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms