RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476599.2

INIP-204, Transcript of INTS3 and NABP interacting protein, human

TSL 2

Gene INIP, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INIP-204	ENST00000476599	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	ARL5B	Q96KC2	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	C1orf50	Q9BV19	199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	NFU1	Q9UMS0	254 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		12.84	□□□□□ -0.35
INIP-204	ENST00000476599	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FCMR	O60667	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CHRNG	P07510	517 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GSTA1	P08263	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	BCKDHA	P12694	445 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SLC7A1	P30825	629 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	DIO1	P49895	249 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	RAC3	P60763	192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PLAUR	Q03405	335 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	RAB35	Q15286	201 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	MAPK14	Q16539	360 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CARTPT	Q16568	116 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	MUCL1	Q96DR8	90 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PIGU	Q9H490	435 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		12.83	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	RIPK2	O43353	540 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PLIN3	O60664	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SHBG	P04278	402 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	UROS	P10746	265 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	IL2RG	P31785	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SESN3	P58005	492 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	LGALS3BP	Q08380	585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SELENBP1	Q13228	472 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SKP2	Q13309	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PTGR1	Q14914	329 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GPR68	Q15743	365 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GABRA6	Q16445	453 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	NRF1	Q16656	503 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	MISP	Q8IVT2	679 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	RADIL	Q96JH8	1075 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	C3orf30	Q96M34	536 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	OR7D2	Q96RA2	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CCT7	Q99832	543 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CIB4	A0PJX0	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SMIM23	A6NLE4	172 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	KLF11	O14901	512 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	TBX19	O60806	448 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	IFI6	P09912	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SRD5A1	P18405	259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ATP6V1C1	P21283	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	PRPH2	P23942	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ARRB2	P32121	409 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SERPINB4	P48594	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ATP12A	P54707	1039 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	MERTK	Q12866	999 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	OR5W2	Q8NH69	310 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ZG16B	Q96DA0	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
INIP-204	ENST00000476599	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms