RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473034.5

RNF25-204, Transcript of ring finger protein 25, human

TSL 2

Gene RNF25, Length 1,807 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF25-204	ENST00000473034	ACTR1A	P61163	376 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ACTC1	P68032	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ACTA1	P68133	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	POU4F2	Q12837	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	OGG1	O15527	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SOX30	O94993	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	PRKCA	P17252	672 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	NT5E	P21589	574 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ACSL1	P33121	698 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CRMP1	Q14194	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GAS6	Q14393	721 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	OR4C6	Q8NH72	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034		A0A1B0GWA3	101 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CBX7	O95931	251 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CD1A	P06126	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF3	P17036	446 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GABRA3	P34903	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	OR10A3	P58181	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	OR12D2	P58182	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ZAR1	Q86SH2	424 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FAM3C	Q92520	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	FGF14	Q92915	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNF25-204	ENST00000473034	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034		H0Y8X5	98 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034		J3QLW9	94 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	CLU	P10909	449 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	ZNF19	P17023	458 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	SLC6A6	P31641	620 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNF25-204	ENST00000473034	LSS	P48449	732 aa		13.71	□□□□□ -0.22

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