RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF81P51508 661 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CLCN7P51798 805 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CSNK1G2P78368 415 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35A2P78381 396 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 LGALS3BPQ08380 585 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZMYND11Q15326 602 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SGCBQ16585 318 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR2L5Q8NG80 312 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 COQ8BQ96D53 544 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 VMP1Q96GC9 406 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM80Q96HE8 168 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF607Q96SK3 696 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 MENTQ9BUN1 341 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ACPTQ9BZG2 426 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 RDH8Q9NYR8 311 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 METTL15A6NJ78 407 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GABRR3A8MPY1 467 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 AGAP14A8MT82 685 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC3AO75596 197 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 WISP1O95388 367 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 HPP00738 406 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SDC1P18827 310 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC9A3P48764 834 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TGM4P49221 684 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CENPAP49450 140 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CCR4P51679 360 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 KEAP1Q14145 624 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC58Q4VC31 144 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC35B4Q969S0 331 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TXNDC15Q96J42 360 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 MND1Q9BWT6 205 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PRORYQ9H606 182 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 VNN3Q9NY84 501 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PPT2Q9UMR5 302 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GLOD5A6NK44 160 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR7A17O14581 309 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SSX4O60224 188 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ICMTO60725 284 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TRIOO75962 3097 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 TIAF1O95411 115 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CDK1P06493 297 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ADORA3P0DMS8 318 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 MPIP34949 423 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 CSRP3P50461 194 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 FGFBP1Q14512 234 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF766Q5HY98 468 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF613Q6PF04 617 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR1F2PQ96R84 312 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 RNF121Q9H920 327 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.55□□□□□ -1.52
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PPK0 400 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms