RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448183.6

NEDD9-204, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD9, Length 4,934 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-204ENST00000448183 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 USP53Q70EK8 1073 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 FCRLAQ7L513 359 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 CD163Q86VB7 1156 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 LSMEM2Q8N112 164 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ASB11Q8WXH4 323 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 INIPQ9NRY2 104 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 POM121CA8CG34 1229 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 CD300LBA8K4G0 201 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 GMDSO60547 372 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 P04436 131 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 DAPP51397 102 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 CDK3Q00526 305 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SORDQ00796 357 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HBMQ6B0K9 141 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 LAX1Q8IWV1 398 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.247e-7■□□□□ 10.6
NEDD9-204ENST00000448183 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 NIPAL2Q9H841 368 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 MED17Q9NVC6 651 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 GJE1A6NN92 205 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 F5H5K5 113 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ACOT8O14734 319 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 PTHP01270 115 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 PRKAR1BP31321 381 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 CAV3P56539 151 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 KIR2DS3Q14952 304 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 BATFQ16520 125 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 TAZQ16635 292 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RTL6Q6ICC9 239 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF480Q8WV37 535 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 STRADBQ9C0K7 418 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 FBRSQ9HAH7 460 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 TRIM64BA6NI03 449 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HHLA1C9JL84 531 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC43A1O75387 559 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SCG5P05408 212 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 MMP2P08253 660 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 AOAHP28039 575 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SQSTM1Q13501 440 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 DPPA4Q7L190 304 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OR7D2Q96RA2 312 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 MYADMQ96S97 322 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 H3BML4 177 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 J3KTA2 159 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 OIP5O43482 229 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 AP1G1O43747 822 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 GPR137BO60478 399 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC16A7O60669 478 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 PROS1P07225 676 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 CD79BP40259 229 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC1A3P43003 542 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 EMP2P54851 167 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC14A1Q13336 389 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 GPR18Q14330 331 aa7.28□□□□□ -1.24
NEDD9-204ENST00000448183 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms