RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ST6GAL1P15907 406 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 CD53P19397 219 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 MAP2K3P46734 347 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF85Q03923 595 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 TRIQKQ629K1 86 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 UTS2BQ765I0 119 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 OR4C6Q8NH72 309 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 ENKURQ8TC29 256 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SHQ1-202ENST00000444040 IDH3BO43837 385 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SLC19A2O60779 497 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R3DO95685 299 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 MT-ND5P03915 603 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GUSBP08236 651 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ELK1P19419 428 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SHC1P29353 583 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 E2F1Q01094 437 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF614Q8N883 585 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NDC1Q9BTX1 674 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PEPDP12955 493 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 F8A1P23610 371 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SLC16A1P53985 500 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ZFP69Q49AA0 526 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HBMQ6B0K9 141 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RTL4Q6ZR62 310 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OAFQ86UD1 273 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR10H2O60403 315 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SC5DO75845 299 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SOX30O94993 753 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 QPRTQ15274 297 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 IDNKQ5T6J7 187 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ARL9Q6T311 187 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OOSP2Q86WS3 158 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 C4orf36Q96KX1 117 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 POMT2Q9UKY4 750 aa14.76□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HRKO00198 91 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF3P17036 446 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TYRP1P17643 537 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HK1P19367 917 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 THBS2P35442 1172 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SMPDL3BQ92485 455 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 VSTM2LQ96N03 204 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GDF15Q99988 308 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM2Q9C040 744 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 MSRAQ9UJ68 235 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 CENPXA8MT69 81 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 AGRPO00253 132 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 LYRM1O43325 122 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 GYPBP06028 91 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 OR12D2P58182 307 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HHEXQ03014 270 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FAM53BQ14153 422 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 PLET1Q6UQ28 207 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HMGB4Q8WW32 186 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.75□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FOXS1O43638 330 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 HLA-DMAP28067 261 aa14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SHQ1-202ENST00000444040 FZD2Q14332 565 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms