RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 JKAMPQ9P055 326 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIVEP2P31629 2446 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 JMJD1CQ15652 2540 aa9.77□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PQD3 144 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM64BA6NI03 449 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 AIM2O14862 343 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANGPTL1O95841 491 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL6P05231 212 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 GUSBP08236 651 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 MATN1P21941 496 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 RFX3P48380 749 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUT5Q11128 374 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXF2Q12947 444 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CD226Q15762 336 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 AGKQ53H12 422 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR52E6Q96RD3 313 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDF2Q99470 211 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZBTB18Q99592 522 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 MED18Q9BUE0 208 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSN1Q9H410 356 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.76□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PPR1 153 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM234BA2RU67 622 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC154A6NI56 674 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUXAA6NLW8 204 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 RCBTB2O95199 551 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 AK1P00568 194 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CPN1P15169 458 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPP4P27487 766 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNJ5P48544 419 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 LHX2P50458 406 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 MVDP53602 400 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACKR1Q16570 336 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL26Q53HC5 615 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFNEQ86WN2 208 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFP90Q8TF47 636 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 PANX1Q96RD7 426 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 THTPAQ9BU02 230 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR51I1Q9H343 314 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 MED11Q9P086 117 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 HMGN4O00479 90 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANGPT2O15123 496 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3C-202ENST00000428892 FCMRO60667 390 aa9.74□□□□□ -0.85
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