RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414879.5

PTPRF-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 2

Gene PTPRF, Length 4,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-205	ENST00000414879	YY2	O15391	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	UTS2	O95399	124 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TNFRSF1B	P20333	461 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ACOT8	O14734	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	S100A1	P23297	94 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MAP2K6	P52564	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC16A6	O15403	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	DIRAS3	O95661	229 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	GABRG2	P18507	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	IST1	P53990	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C18orf63	Q68DL7	685 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879		A8MVM7	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MBTPS2	O43462	519 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TCN2	P20062	427 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	STT3A	P46977	705 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ZP2	Q05996	745 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MLC1	Q15049	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	LINC01565	O15544	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	VAMP5	O95183	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PPIC	P45877	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SFTPD	P35247	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	PPP5C	P53041	499 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR1D5	P58170	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	OR2T27	Q8NH04	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	GATA6	Q92908	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879		A0A1W2PPC1	479 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRF-205	ENST00000414879	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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