RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR70Q9NW82 654 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NCOR1O75376 2440 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CDHR4A6H8M9 788 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ST6GAL1P15907 406 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TIGD3Q6B0B8 471 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SMARCD3Q6STE5 483 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 AVL9Q8NBF6 648 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52L1Q8NGH7 329 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM43Q9BTV4 400 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HCAR1Q9BXC0 346 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LYRM4Q9HD34 91 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP22Q9NRW4 184 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WV62 115 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PPC4 97 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM25AB3EWG3 89 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM25CB3EWG5 89 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM25GB3EWG6 89 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX12O00623 359 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP1B1P05026 303 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 IFI30P13284 250 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 IL18Q14116 193 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMKVQ8NCB2 501 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NACC2Q96BF6 587 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG8Q9BVK2 526 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PLOD3O60568 738 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAR1AP10644 381 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PAMR1Q6UXH9 720 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRILQ7L0X0 811 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD13Q7L211 337 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT13Q7L8C5 426 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NR2C2APQ86WQ0 139 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM99Q8N816 258 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GPBAR1Q8TDU6 330 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOXLQ9NUZ1 547 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SGK494L7N484 410 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF10CO14798 259 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LYRM1O43325 122 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FMO6PO60774 539 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PSKH1P11801 424 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP7P18075 431 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 YPEL5P62699 121 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 YIPF7Q8N8F6 280 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CDRT4Q8N9R6 151 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LMX1AQ8TE12 382 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PTP4A1Q93096 173 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 STACQ99469 402 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPA7E9PJI5 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF17O60258 216 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ALX3O95076 343 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPA8P0DM63 369 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K8P41279 467 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RFX3P48380 749 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MTNR1BP49286 362 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 THSD4Q6ZMP0 1018 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MARVELD1Q9BSK0 173 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNN2Q9H2S1 579 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PRO3102Q9H379 93 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG5Q9Y673 324 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN20P56880 219 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ERV3-1Q14264 604 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GALEQ14376 348 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GARNL3Q5VVW2 1013 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NKAIN2Q5VXU1 208 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 COX18Q8N8Q8 333 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 GRPEL2Q8TAA5 225 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CMC2Q9NRP2 79 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6C70A6NIJ9 312 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC19A2O60779 497 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RCBTB2O95199 551 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SHC2P98077 582 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXK2Q01167 660 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PLAURQ03405 335 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FAPQ12884 760 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 EFR3AQ14156 821 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TSSK4Q6SA08 328 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms