RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CHST6Q9GZX3 395 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 XKRY2A2RUG3 117 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A6NLC8 198 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 EPHB6O15197 1021 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DQB2P05538 268 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AKR1C4P17516 323 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ADRA2CP18825 462 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ITGA3P26006 1051 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CCR9P51686 369 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R38P59533 333 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 DHODHQ02127 395 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GINS1Q14691 196 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MLC1Q15049 377 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CNIH2Q6PI25 160 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC15A4Q8N697 577 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 WDR48Q8TAF3 677 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PCED1BQ96HM7 432 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR10A5Q9H207 317 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR10A2Q9H208 303 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PLK3Q9H4B4 646 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 POMT2Q9UKY4 750 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPH5 198 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MROH6A6NGR9 719 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GABRB3P28472 473 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CASP3P42574 277 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CLRN1P58418 232 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MTPNP58546 118 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR9A2Q8NGT5 310 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PCTPQ9UKL6 214 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SBF1O95248 1867 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GLOD5A6NK44 160 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PIRO00625 290 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CFIP05156 583 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ITGA5P08648 1049 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR4Q2P0C623 313 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OPRL1P41146 370 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf57Q0VDD7 668 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CATR1Q13166 79 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PODNL1Q6PEZ8 512 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ANKK1Q8NFD2 765 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NETO1Q8TDF5 533 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 COPS9Q8WXC6 57 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HHLA2Q9UM44 414 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CDK2AP1O14519 115 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS4O75173 837 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 YIF1AO95070 293 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CD1AP06126 327 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 VAMP1P23763 118 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GGT5P36269 586 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SULT1A2P50226 295 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MADCAM1Q13477 382 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PON2Q15165 354 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ELOCQ15369 112 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TSSK4Q6SA08 328 aa4.62□□□□□ -1.67
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