RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRU-201ENST00000345512 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
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PTPRU-201ENST00000345512 APOOQ9BUR5 198 aa14.45□□□□□ -0.1
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A0A6YYJ9 748 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 MAN2B1O00754 1011 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 RAD1O60671 282 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 TNFP01375 233 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
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PTPRU-201ENST00000345512 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRU-201ENST00000345512 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.45□□□□□ -0.1
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