RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLC31A2O15432 143 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MTHFD2P13995 350 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLC35A2P78381 396 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 GIMAP5Q96F15 307 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SC5DO75845 299 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FCGR2AP12318 317 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 KITLGP21583 273 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 POU4F3Q15319 338 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ULBP2Q9BZM5 246 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PREBQ9HCU5 417 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 RAB3DO95716 219 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ILKQ13418 452 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MYOTQ9UBF9 498 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FBXO24O75426 580 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CD38P28907 300 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FOXA1P55317 472 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PNCKQ6P2M8 343 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF384Q8TF68 577 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.91□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SDHDO14521 159 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PAHP00439 452 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CRABP1P29762 137 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ETV4P43268 484 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 VEGFCP49767 419 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IL13RA1P78552 427 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SULF2Q8IWU5 870 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.9□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FETUBQ9UGM5 382 aa9.9□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 H3BMQ9 156 aa9.9□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 CBR1P16152 277 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TMBIM6P55061 237 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MLF1P58340 268 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TGFBR3Q03167 851 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 AKR1C1Q04828 323 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FADDQ13158 208 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TRILQ7L0X0 811 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 APMAPQ9HDC9 416 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN11A1L157 253 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 F5H5P2 479 aa9.9□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 PRSS3P35030 304 aa9.9□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 MYBPHQ13203 477 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PDE7AQ13946 482 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SERTAD2Q14140 314 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 INTS14Q96SY0 518 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NUP98P52948 1817 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FIBINQ8TAL6 211 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TMEM239Q8WW34 195 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.9□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CYB5BO43169 146 aa9.9□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF4O60810 478 aa9.9□□□□□ -0.83
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