RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 THAP4Q8WY91 577 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF681Q96N22 645 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SARGQ9BW04 601 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 J3QLW9 94 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 LGALS8O00214 317 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 EMC8O43402 210 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 THY1P04216 161 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 WNT1P04628 370 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF19P17023 458 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OMPP47874 163 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 LBX1P52954 281 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GALEQ14376 348 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2M4Q96R27 311 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 NUP50Q9UKX7 468 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.51■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SCN2AQ99250 2005 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SIGLEC5O15389 551 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SOX30O94993 753 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TNFRSF4P43489 277 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GCGRP47871 477 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GRK1Q15835 563 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OAFQ86UD1 273 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 COL26A1Q96A83 441 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TIMP4Q99727 224 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 PINK1Q9BXM7 581 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CD93Q9NPY3 652 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DIABLOQ9NR28 239 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SPTBP11277 2137 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 F5P12259 2224 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ZP1P60852 638 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TGM3Q08188 693 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 PUDPQ08623 228 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TSPAN31Q12999 210 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SHHQ15465 462 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 HBMQ6B0K9 141 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DDOQ99489 341 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DPH1Q9BZG8 443 aa16.5■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1W2PQF6 199 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DAPL1A0PJW8 107 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 ADRB1P08588 477 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 BTG1P62324 171 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 NDUFA9Q16795 377 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RTL4Q6ZR62 310 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 Q6ZTK2 550 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 MTSS1LQ765P7 747 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC51BQ86UW2 128 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5W2Q8NH69 310 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 LINC00052Q96N35 136 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 DLL4Q9NR61 685 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 KNL1Q8NG31 2342 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CHST10O43529 356 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 HOXB2P14652 356 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 GSTM3P21266 225 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGEB1P43366 347 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR12D2P58182 307 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RFKQ969G6 155 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 MOAP1Q96BY2 351 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10A4Q9H209 315 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.49■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5K3A6NET4 321 aa16.48■□□□□ 0.23
TSPAN17-201ENST00000298564 H3BUI4 141 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms