RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTRK2Q16620 822 aa21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACER2Q5QJU3 275 aa21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASB15Q8WXK1 588 aa21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCHR1Q99705 422 aa21.81■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENTPD8Q5MY95 495 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC15A4Q8N697 577 aa21.8■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC38A4Q969I6 547 aa21.8■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAGAP17050 411 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSPHP78330 225 aa21.8■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFR3AQ14156 821 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5M10Q6IEU7 315 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM156Q8N614 296 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4K5Q8NGD3 323 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5F1O95221 314 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBL4AP11441 157 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSMP13725 252 aa21.79■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BROXQ5VW32 411 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP54Q7Z3B4 507 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM71CQ8NEG0 241 aa21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE2FQ969M7 185 aa21.79■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFB5O43674 189 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NGFRP08138 427 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF117Q03924 483 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COX10Q12887 443 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SKP2Q13309 424 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OPN5Q6U736 354 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENTHD1Q8IYW4 607 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THAP4Q8WY91 577 aa21.78■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF6Q9Y252 685 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.78■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTNP21246 168 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHMP24386 653 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FMO3P31513 532 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSNK2BP67870 215 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GALNT16Q8N428 558 aa21.78■■□□□ 1.08
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASSF1Q9NS23 344 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCN3BQ9NY72 215 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STMN3Q9NZ72 180 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A087WUU8 490 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PQD3 144 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF264O43296 627 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCL3P10147 92 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTKP33981 857 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFNGR2P38484 337 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADH7P40394 386 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCR4P51679 360 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAS1P54826 345 aa21.77■■□□□ 1.08
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