RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTA1P68133 377 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC10A1Q14973 349 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SUN5Q8TC36 379 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TANKQ92844 425 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ALG8Q9BVK2 526 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PELI2Q9HAT8 420 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GNG12Q9UBI6 72 aa11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC19A2O60779 497 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 YIF1AO95070 293 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BCL2A1Q16548 175 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OLIG3Q7RTU3 272 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2T27Q8NH04 317 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPN3P20807 821 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CRABP1P29762 137 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PXKQ7Z7A4 578 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM239Q8WW34 195 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 EPOP01588 193 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 F3P13726 295 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB3BP20337 219 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HLA-DMAP28067 261 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CCR7P32248 378 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 KDELR2P33947 212 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 AHRP35869 848 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 KIR2DS3Q14952 304 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TCTN2Q96GX1 697 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 AGTR1P30556 359 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BCL6P41182 706 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MTNR1AP48039 350 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM111BQ6SJ93 734 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 DEFB124Q8NES8 71 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RGNQ15493 299 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BEX5Q5H9J7 111 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.1□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A096LPE4 126 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PPZ6 126 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ANTXRLA6NF34 631 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHG1P01857 330 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PCSK2P16519 638 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RGRP47804 291 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BIDP55957 195 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CST9LP1Q5W188 147 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 C18orf63Q68DL7 685 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PIANPQ8IYJ0 282 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SDHDO14521 159 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TFF2Q03403 129 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SFXN5Q8TD22 340 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 C4orf36Q96KX1 117 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF21Q9NSA1 209 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 M0QZQ0 153 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PRRG2O14669 202 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PIP5K1CO60331 668 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PRAMEF4O60810 478 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ARSBP15848 533 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ENPP1P22413 925 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 POU4F2Q12837 409 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC43A2Q8N370 569 aa11.09□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms