RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 NEIL2Q969S2 332 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 RGMAQ96B86 450 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ABCG4Q9H172 646 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.66□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 A0A087WUU8 490 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 GFYI3L273 518 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 IFNGR1P15260 489 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 SLC16A1P53985 500 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 DYRK1AQ13627 763 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 GUCA2BQ16661 112 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 LINC00303Q3SY05 128 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 SPICQ8N5J4 248 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 OR52I2Q8NH67 350 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ABHD4Q8TB40 342 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 KAT2AQ92830 837 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ZNF607Q96SK3 696 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 FAM25EA8MYX2 175 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 UGDHO60701 494 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 SERPINA3P01011 423 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ACSM1Q08AH1 577 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ADGRF1Q5T601 910 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 KLK6Q92876 244 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 MARK1Q9P0L2 795 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 CCL26Q9Y258 94 aa14.65□□□□□ -0.06
DDX1-201ENST00000233084 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 YKT6O15498 198 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 REM1O75628 298 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SLC16A8O95907 504 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 IGHA1P01876 353 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HSD3B2P26439 372 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 IGFLR1Q9H665 355 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 EMC3Q9P0I2 261 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.65□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RAB19A4D1S5 217 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR6C68A6NDL8 312 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TMEM202A6NGA9 273 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OR2AG2A6NM03 316 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HMGN4O00479 90 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SURF4O15260 269 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PTGER1P34995 402 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 GPR4P46093 362 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PREPP48147 710 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HYAL1Q12794 435 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MED27Q6P2C8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 ASPGQ86U10 573 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 TMEM17Q86X19 198 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 MFFQ9GZY8 342 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 NIT2Q9NQR4 276 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 OPN4Q9UHM6 478 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.64□□□□□ -0.07
DDX1-201ENST00000233084 DAPL1A0PJW8 107 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms