RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	LNX2	Q8N448	690 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624		H7BY64	318 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	AIP	O00170	330 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ13	O60928	360 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SPARC	P09486	303 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC6A1	P30531	599 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CCR8	P51685	355 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ACVR1	Q04771	509 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SP140	Q13342	867 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	LGI1	O95970	557 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SOD1	P00441	154 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ACP5	P13686	325 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ENPP1	P22413	925 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59	2e-6	■■□□□ 13.1
PXN-222	ENST00000637624	PDHA2	P29803	388 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CCR9	P51686	369 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	POU4F2	Q12837	409 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	BET1	O15155	118 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	GMFG	O60234	142 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ACHE	P22303	614 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MAP3K8	P41279	467 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR4K13	Q8NH42	304 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR52I2	Q8NH67	350 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RNF170	Q96K19	258 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RBP7	Q96R05	134 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	TTC3	P53804	2025 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624		A0A0B4J293	547 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ADAM12	O43184	909 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	AKR1C4	P17516	323 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MPI	P34949	423 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MVD	P53602	400 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	TDG	Q13569	410 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	KLK6	Q92876	244 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	NPAS1	Q99742	590 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	CST11	Q9H112	138 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	HIST1H2AB	P04908	130 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	GNAL	P38405	381 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	BAMBI	Q13145	260 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZVU0	165 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PXN-222	ENST00000637624	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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