RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNGR1	O43759	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF8	O76064	485 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CRTAM	O95727	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OTC	P00480	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	UROS	P10746	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH1	P12830	882 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ME2	P23368	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A2	P23975	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MIP	P30301	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LIM2	P55344	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	STX17	P56962	302 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IL5RA	Q01344	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FHL3	Q13643	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LY6E	Q16553	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IPMK	Q8NFU5	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	APH1A	Q96BI3	265 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC7	Q99615	494 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GLOD4	Q9HC38	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MED11	Q9P086	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MALT1	Q9UDY8	824 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1I1	O60431	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TOX4	O94842	621 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	BRI3	O95415	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CLPS	P04118	112 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGF1	P05019	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CALB1	P05937	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	THRB	P10828	461 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX7	P23759	505 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNS	P34059	522 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CFHR2	P36980	270 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MYCNOS	P40205	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ASMT	P46597	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RAC1	P63000	192 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	COX10	Q12887	443 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CBLL1	Q75N03	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SCAI	Q8N9R8	606 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LHX4	Q969G2	390 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RNFT2	Q96EX2	444 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL15	Q96M94	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD6	Q9BX69	1037 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NANS	Q9NR45	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBC2	A0A5B9	178 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NJY4	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BUX3	64 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FBP2	O00757	339 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF17	O60258	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EED	O75530	441 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PAH	P00439	452 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV2-70	P01814	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ELANE	P08246	267 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TBPL1	P62380	186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6

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