RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625712.2

RAB34-222, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB34, Length 994 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-222	ENST00000625712	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712		A0A1W2PNR3	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	GJE1	A6NN92	205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	KLF4	O43474	513 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	SMPD2	O60906	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	SCN2B	O60939	215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	CYP7B1	O75881	506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	AK1	P00568	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	PPP3CB	P16298	524 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF141	Q15928	474 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	STK32C	Q86UX6	486 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	CCL19	Q99731	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	PIP5K1A	Q99755	562 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RAB34-222	ENST00000625712	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	STX11	O75558	287 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	UGT2B17	O75795	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PLAU	P00749	431 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	LBP	P18428	481 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	FPR1	P21462	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ENPP1	P22413	925 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	STX3	Q13277	289 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SKP2	Q13309	424 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	CBFB	Q13951	182 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	MAPK14	Q16539	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712		Q5PR19	223 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	RAB8B	Q92930	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PIGT	Q969N2	578 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TESC	Q96BS2	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712		C9JVG2	144 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	H6PD	O95479	791 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	CSTA	P01040	98 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	C1QC	P02747	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	UQCRC2	P22695	453 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SLC7A1	P30825	629 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	NME5	P56597	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	BST1	Q10588	318 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	FUT5	Q11128	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	CASP8	Q14790	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RAB34-222	ENST00000625712	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25

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