RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIGXQ8TBF5 258 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PHYHIPQ92561 330 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB8BQ92930 207 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR1F2PQ96R84 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR51M1Q9H341 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 TDP1Q9NUW8 608 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MBD2Q9UBB5 411 aa6.5□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 NUDT19A8MXV4 375 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 M0QZ92 97 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 UBE2CO00762 179 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF197O14709 1029 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OGG1O15527 345 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FLRT2O43155 660 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SH3BGRLO75368 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARL6IP5O75915 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 VNN2O95498 520 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPP1P10451 314 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADCYAP1P18509 176 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SDHBP21912 280 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 NOS3P29474 1203 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PTH2RP49190 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SSTP61278 116 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ECH1Q13011 328 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SYPL1Q16563 259 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 AVPI1Q5T686 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARL9Q6T311 187 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR2T33Q8NG76 320 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRI1Q9BV20 369 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SGPP1Q9BX95 441 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MFFQ9GZY8 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 GLTPD2A6NH11 291 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 DISC1C4P0D8 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SIGLEC5O15389 551 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SSX5O60225 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 RDH16O75452 317 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 STC2O76061 302 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 CD8AP01732 235 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 GBAP04062 536 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 GLAP06280 429 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 KLK1P06870 262 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF35P13682 527 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPP4P27487 766 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ART1P52961 327 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 PTSQ03393 145 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 LGALS3BPQ08380 585 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 STX4Q12846 297 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MELKQ14680 651 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPNMBQ14956 572 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 CORO6Q6QEF8 472 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 CPOQ8IVL8 374 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 LILRB2Q8N423 598 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MED8Q96G25 268 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-212ENST00000620722 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms