RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341		Q8N402	240 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1W2PPK0	400 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	IRGM	A1A4Y4	181 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	HLA-DPB1	P04440	258 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	PSKH1	P11801	424 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	TBXA2R	P21731	343 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	HTR1F	P30939	366 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CTH	P32929	405 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CD83	Q01151	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ALG11	Q2TAA5	492 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	AP3S1	Q92572	193 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	SLC22A4	Q9H015	551 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SMTN-222	ENST00000612341	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	URAD	A6NGE7	173 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	RDH16	O75452	317 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINI2	O75830	405 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	CTBP2	P56545	445 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341		Q6ZSR6	202 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0X1KG70	313 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	OR10H2	O60403	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HMGN1	P05114	100 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	INPP1	P49441	399 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HYAL1	Q12794	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	PIGU	Q9H490	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	CLDND1	Q9NY35	253 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341		E9PI62	339 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	RFPL3	O75679	317 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ACVR1B	P36896	505 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HCCS	P53701	268 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	SEC16A	O15027	2179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	PLA2G10	O15496	165 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	KLF4	O43474	513 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	DUSP8	Q13202	625 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SMTN-222	ENST00000612341	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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