RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP4K2Q12851 820 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SPHARQ15513 63 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF836Q6ZNA1 936 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 OLIG3Q7RTU3 272 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCST2Q5T1A1 773 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 GDF7Q7Z4P5 450 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 MROQ9BYG7 248 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 NINQ8N4C6 2090 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD1O60671 282 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX2-2O95096 273 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 COX18Q8N8Q8 333 aa23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR51E2Q9H255 320 aa23.46■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM5Q9Y2B1 443 aa23.46■■□□□ 1.35
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