RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAL3ST4Q96RP7 486 aa26.12■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC42EP2O14613 210 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN2O60636 221 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 IRF3Q14653 427 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SAGE2PA6NJ88 616 aa26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRMUO75648 421 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ST3GAL4Q11206 333 aa26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLCO6A1Q86UG4 719 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC34A3Q8N130 599 aa26.11■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TP53INP1Q96A56 240 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPSB2Q99619 263 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDCA4Q9BXL8 241 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 UNC119BA6NIH7 251 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCDO00767 359 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK20Q8IZL9 346 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GRHL3Q8TE85 626 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL21AQ8WXB1 218 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC38A2Q96QD8 506 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSSK6Q9BXA6 273 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 C20orf141Q9NUB4 165 aa26.1■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BMQ9 156 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFI30P13284 250 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 HPGDP15428 266 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAKP20794 623 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNLIPRP2P54317 469 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SKP2Q13309 424 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM205Q6UW68 189 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 STX19Q8N4C7 294 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM163Q8TC26 289 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BPIFA2Q96DR5 249 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR54Q9H977 334 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PQD3 144 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGRPO00253 132 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 STSP08842 583 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCSK6P29122 969 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCKBRP32239 447 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD226Q15762 336 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNAPC1Q16533 368 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAAH2Q6GMR7 532 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 APOOLQ6UXV4 268 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 APCDD1LQ8NCL9 501 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF31Q96EP0 1072 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADOQ96SZ5 270 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX12Q9BXU0 123 aa26.08■■□□□ 1.77
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CTDNEP1-210ENST00000574322 UBL4AP11441 157 aa26.08■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PLAG1Q6DJT9 500 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 LCN10Q6JVE6 187 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTRCQ99895 268 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL7BQ9BQE9 202 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPH1Q9BZG8 443 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 NRSN2Q9GZP1 204 aa26.08■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 AHCYL1O43865 530 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL12BP29460 328 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXL2P58012 376 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF4P78317 190 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFAF6Q330K2 333 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLRX5Q86SX6 157 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4Q3Q8NH05 313 aa26.07■■□□□ 1.76
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