RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CYTIP	O60759	359 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TBX19	O60806	448 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	CSF3	P09919	207 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PRKCA	P17252	672 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SRD5A1	P18405	259 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	IGFBP5	P24593	272 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	PTAFR	P25105	342 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL26	Q53HC5	615 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-238	ENST00000568169	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169		C9JVG2	144 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169		H3BQF6	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SEC22B	O75396	215 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	NUDT14	O95848	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	PRPH2	P23942	346 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	CD40	P25942	277 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SLC7A1	P30825	629 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	GZMK	P49863	264 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FABP6	P51161	128 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	EFNA4	P52798	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SPOCK1	Q08629	439 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SZRD1	Q7Z422	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	STAC	Q99469	402 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	AKAP10	O43572	662 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	RAD51D	O75771	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	H6PD	O95479	791 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF83	P51522	516 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	PDE7A	Q13946	482 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF527	Q8NB42	609 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	JADE3	Q92613	823 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	CDS1	Q92903	461 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	FCRL1	Q96LA6	429 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	CCT7	Q99832	543 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	PIGU	Q9H490	435 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	GIN1	Q9NXP7	522 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	ESPN	B1AK53	854 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169		H3BNH8	94 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	LY6H	O94772	140 aa		10	□□□□□ -0.81
TCF4-238	ENST00000568169	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81

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