RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 MISPQ8IVT2 679 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 MUC15Q8N387 334 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GPR119Q8TDV5 335 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 C3orf49Q96BT1 292 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 OR5B2Q96R09 309 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 REEP4Q9H6H4 257 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 BCO1Q9HAY6 547 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 PLCE1Q9P212 2302 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQD3 144 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 H6PDO95479 791 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 PYGBP11216 843 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SLC25A16P16260 332 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SRD5A1P18405 259 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SERPINB4P48594 390 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GGTLC2Q14390 218 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 KIAA0040Q15053 153 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RELL1Q8IUW5 271 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SLC43A2Q8N370 569 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ELOA3Q8NG57 546 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 BTBD2Q9BX70 525 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 EMCNQ9ULC0 261 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CIB4A0PJX0 185 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 OR5H1A6NKK0 313 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 G3V2L1 256 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RGS14O43566 566 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CYTIPO60759 359 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CYP7B1O75881 506 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SDC1P18827 310 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ATP6V1C1P21283 382 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 DSCR9P59020 149 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RAC3P60763 192 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 QPRTQ15274 297 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 OR2T11Q8NH01 316 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FMO2Q99518 471 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GP6Q9HCN6 339 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 HHATLQ9HCP6 504 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 NTMQ9P121 344 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 PGM3O95394 542 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 IFI6P09912 130 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 MYL2P10916 166 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 COX5AP20674 150 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CD40P25942 277 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 ECHS1P30084 290 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 SELENBP1Q13228 472 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 CARTPTQ16568 116 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 KLHL26Q53HC5 615 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 RADILQ96JH8 1075 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TMEM160Q9NX00 188 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 C1orf109Q9NX04 203 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TBK1Q9UHD2 729 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 LINC00032P0C843 101 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CS-227ENST00000551441 TP53BP2Q13625 1128 aa14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms