RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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CASC18-202ENST00000548557 SERPINB10P48595 397 aa6.09□□□□□ -1.43
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CASC18-202ENST00000548557 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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CASC18-202ENST00000548557 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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CASC18-202ENST00000548557 STRADBQ9C0K7 418 aa6.09□□□□□ -1.43
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